医療施設での感染対策の基本は、日常的に隔離予防策（標準予防策、感染経路別対策）を実施することです。「医療現場における隔離予防策のためのガイドライン2007」は、1996年に公開された「病院における隔離予防策のためのガイドライン」の改訂版です。

改訂されたガイドラインは、急性期病院からクリニック、長期療養施設、在宅治療などすべての医療環境を対象とした内容となっています。すべての医療現場において感染対策の基本である標準予防策を実施することの重要性が再確認され、感染経路別予防策を実施することの重要性を再度強調しているガイドラインです。改訂版で呼吸器衛生（咳エチケットなど）が追加されました。このほか、SARSや高病原性鳥インフルエンザなど新たに流行している感染症に関する勧告が示されています。

医療機関で実施すべき手指の衛生に関するガイドラインです。医療現場における手洗いと手指消毒についてのデータを評価し、手指衛生法の改善を促進し、医療の現場において患者や医療スタッフへの病原微生物の伝播を減少させるための具体的な勧告を示しているガイドラインです。

特に医療従事者と免疫不全患者の間で、環境を介した感染の予防のためのデータを評価し、再確認した環境感染管理ガイドラインです。

患者ケア用医療器具の洗浄・消毒・滅菌、および医療環境の洗浄と消毒に関して優先されるべき方法について、エビデンスに基づく勧告を提示しています。

CDCは新型コロナウイルス感染症のガイダンスを公開しています。医療施設での新型コロナウイルス感染症を予防するガイダンスの他に、個人向けの対策や居住地や職場、学校などに分け感染拡大の予防方法に関するガイダンスを紹介しています。パンデミックを引き起こす感染症は、医療機関だけが対策を実施するのではなく、個人や地域、職場や学校など公衆衛生全般で対策を実施する必要があります。地域での予防策のガイダンスの中には、オフィスや学校などの予防策が公開されています。